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百数低代码开发平台_天津紧急发布疫情_品牌营销策划方案范文_东莞建设企业网站

2025/4/2 16:34:18 来源:https://blog.csdn.net/monkeny/article/details/146712976  浏览:    关键词:百数低代码开发平台_天津紧急发布疫情_品牌营销策划方案范文_东莞建设企业网站
百数低代码开发平台_天津紧急发布疫情_品牌营销策划方案范文_东莞建设企业网站

SwissDock是一款自2010年推出的免费分子对接网络服务,基于EADock DSS算法开发,用于预测靶标蛋白与小分子之间的相互作用。该平台致力于降低分子对接软件的使用门槛,使这一技术不仅限于传统的分子建模领域,还能惠及更广泛的研究人员,包括药物化学、生物医学等领域的非计算专家。

SwissDock提供用户友好的在线界面,支持快速上传蛋白和小分子结构,自动完成对接计算,并可视化分析结果。其提供了两种对接算法的切换,分别是Attracting Cavities以及Autodock Vina。前者后起之秀,后者经典老古董。

使用流程

1. 两种对接算法任你选择

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2. 准备配体

Swiss dock支持多种配体输入方式:
①输入配体分子的SMILE式;
②上传分子的mol2格式文件;
③在线绘制分子结构式

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3. 准备受体

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4. 调整对接口袋位置和大小

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你还可以通过点击蛋白交互视图中的残基而定义口袋的几何中心。

5. 检查参数

点击红色按键检查参数

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6. 提交运行

由于运行时间可能很长,建议留个自己的邮箱,等运行结束会邮件告知你。

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7. 结果页面

你可以通过点击下方的表格中的对接构象来查看视图中的配体结合pose

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视图下方的一行按键可以调控显示相互作用的类型:

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点击右上角小图标保存结果到本地:

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