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Prodigal 是一个用于基因组注释的工具，通常用于预测基因组中的开放阅读框（ORFs）。它能够处理基因组数据并快速生成基因预测结果，广泛应用于微生物基因组学领域。

如果你想在 Ubuntu 上安装 Prodigal，可以按照以下步骤进行：

1.更新包列表

打开终端，确保你的包列表是最新的：

sudo apt update

2.安装 Prodigal

你可以通过 apt 包管理器直接安装 Prodigal：

sudo apt install prodigal

3.验证安装

安装完成后，你可以通过以下命令验证 Prodigal 是否安装成功：

prodigal -v

这将显示 Prodigal 的版本信息，确认安装成功。

4.查看帮助

prodigal -h

5.预测ORF

prodigal -i input.fa -o output_genes.gff -a predicted_proteins.faa -d predicted_genes.fna -p meta