脂质是全球重要的大宗商品和工业原料。世界上消耗的24种脂质中，大部分来自植物。全面了解不同油料作物中与脂质生物合成相关的基因和机制，对于通过分子生物学和育种来提高这些作物的含油性状至关重要。
2024年2月，Plant Communications在线发表了一篇一个跨多种作物物种的综合脂质数据库——CLAIR，该数据库跨越了多个作物物种，旨在提供关于植物脂类代谢的基因及相关信息的资源和参考。该数据库可访问地址：http://www.clipair.cn/。
该数据库专门用于九种主要油籽的脂质代谢，通过整合49个公共数据库和挖掘1200多篇相关文献数据，构建了油料作物脂质代谢基因集，该基因集包含了996个脂质代谢相关的基因，其中221个是新添加的。此外，该基因集还包括了54个脂质相关转录因子基因，这些基因可能在脂质代谢调节过程中发挥关键作用。同时，该基因集还提供了多种查询方式，包括基于基因组可视化、表达谱分析等功能模块，方便用户进行深入研究。
CLAIR的用户界面设计简洁方便，有助于研究人员的数据分析和使用。CLAIR支持查询每个物种的脂质代谢相关基因，并提供有关蛋白质家族、途径、序列、表达趋势、基因共表达以及相关QTL的信息。此外，用户还可以下载所有相关数据文件并利用实用工具如JBrowse、BLAST和ID转换器。
图2 CLAIR数据库基因集的数据处理和基因集内容概述
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参考文献
CLAIR: An integrated lipid database across multiple crop species. PLANT COMMUNICATIONS, 2024.