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重庆建设工程交易中心官网_出售手表的网站有哪些_启信聚客通网络营销策划_搜索引擎优化公司排行

2024/12/28 10:22:23 来源:https://blog.csdn.net/qq_27390023/article/details/144490619  浏览:    关键词:重庆建设工程交易中心官网_出售手表的网站有哪些_启信聚客通网络营销策划_搜索引擎优化公司排行
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torsions列表表示氨基酸中侧链二面角(torsion angle)的原子列表。

1. torsions 数据结构

  • torsions 是一个列表,长度为 22(对应20种标准氨基酸 + unk(未知)+ mask(掩码))。
  • 每个元素是一个子列表,子列表包含最多 4 个子元素,每个子元素是由 4 个原子名组成的列表,表示一个 二面角(torsion angle) 的定义。
  • 例外情况
    • 对于没有侧链二面角的氨基酸(如 Glycine, Alanine, Unk, Mask),对应的子列表为 [None, None, None, None]
    • 如果一个氨基酸的侧链只有部分二面角,剩余位置也用 None 填充。

2. 含义

  • 每个元素定义一个二面角
    • 一个二面角由 4 个原子构成,表示四个原子之间的旋转角度(绕其中的键)。

源代码:

torsions=[[ None, None, None, None ],  # ala[ [" N  "," CA "," CB "," CG "], [" CA "," CB "," CG "," CD "], [" CB "," CG "," CD "," NE "], [" CG "," CD "," NE "," CZ "] ],  # arg[ [" N  "," CA "," CB "," CG "], [" CA "," CB "," CG "," OD1"], None, None ],  # asn[ [" N  "," CA ",&

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