1. 孟德尔随机化R包
看一篇文章，介绍孟德尔随机化分析，里面推荐了这两个R包，安装了解一下：
Methods:Genome-wide association study (GWAS) data for autoimmune diseases and AMD were obtained from the IEU Open GWAS database and the FinnGen consortium. A series of stringent SNP filtering steps was applied to ensure the reliability of the genetic instruments. MR analyses were conducted using the TwoSampleMR and MR-PRESSO packages in R. The inverse-variance weighted (IVW) method served as the primary analysis, complemented by multiple supplementary analyses and sensitivity tests.
2. R版本为4.3.1
3. 安装TwoSampleMR
最新的版本为0.6.4（2024-06-12）。下面介绍三种安装方法：
第一种：
该包没有在CRAN中，在github中，可以通过下面命令安装。
# install.packages(‘devtools’)
devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")
第二种：
用remote包进行安装：
install.packages("remotes")
remotes::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")
第三种：
也可以直接安装：
install.packages("TwoSampleMR", repos = c("https://mrcieu.r-universe.dev", "https://cloud.r-project.org"))
如果让选择是否更新，可以选择1，全部更新。
然后就是漫长的等待，把每个依赖包都更新安装好：
安装成功，载入试试：
搞定。
4. 安装TwoSampleMR
安装代码：
devtools::install_github("rondolab/MR-PRESSO")
安装成功：
后面介绍一下这两个包的使用方法。